انتقاد‌ها از دولت سیزدهم به دلیل وضعیت بد اقتصادی و افزایش شدید قیمت‌ها به شدت اوج گرفته و حتی مراجع تقلید در سفر رئیسی به قم این گلایه و انتقاد را نسبت به دولت سیزدهم نشان دادند، با این حال موضوع بحث‌برانگیز تقسیمات کشوری در صدر برنامه‌های دولت قرار گرفته و محمد حسینی، معاون پارلمانی رئیس‌جمهور می‌گوید که تقسیمات کشوری درحال حاضر در کمیسیون سیاسی و صحن دولت مطرح است و مربوط به استان‌های متعددی می‌شود.

احمد وحیدی، وزیر کشور دولت سیزدهم درباره مطرح شدن پرونده نیکا شاکرمی در رسانه‌های خارج‌ازکشور گفت: الان دانشجویان در دانشگاه‌های آمریکا و اروپا در حال حمایت از مردم فلسطین هستند. می‌خواهند توجهات را از این اعتراضات دور کنند. از سویی می‌خواهند عملیات وعده صادق را مخدوش کنند. آن‌ها آمدند و یک سوژه بسیار مضحک که همه ابعاد آن روشن است را مطرح کردند که پاسخ آن هم داده شد و مشخص شد؛ دشمن و رسانه‌های آن‌ها به گزارش‌های دروغ و دور از واقع متوسل شده اند تا عملیات روانی انجام دهند.